Berenice fue fundada en el 275 a.C. por Tolomeo II Filadelfo en honor a su madre, Berenice I, que acababa de morir.
Desde la antigüedad, fue un importante centro comercial para la importación de bienes valiosos, como el oro y el marfil, llegando a ser una de las ciudades más ricas y prosperas de Egipto.
Sin embargo, Las excavaciones arqueológicas que se están llevando a cabo en la antigua ciudad, sugieren que esta fue abandonada por sus habitantes a causa de una sequía provocada probablemente por una catastrófica erupción volcánica que tuvo lugar en algún punto del planeta alrededor el 209 a.C.
Posteriormente, cuando las condiciones mejoraron, la ciudad fue repoblada y durante la epoca del imperio Romano volvió a ser un importante puerto para el comercio con la India y el lejano Oriente, tanto que en ella terminaba la importante arteria llamada Vía Hadriana, que desde Antinoópolis en el Nilo llegaba a la costa del Mar Rojo.
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